Drugi sezon hitu anime Masamune Shirow, cyberpunkowego thrillera par excellence! Major Motoko Kusanagi i Sekcja 9 kontynuują walkę z terroryzmem w świecie rzeczywistym i wirtualnym. Kiedy nowy premier postanawia zreorganizować Sekcję 9, umieszcza zespół Aramakiego pod dowództwem Goudy Kazundo. Trudną sytuację pogarsza pojawienie się Independent Eleven, nowej, bezwzględnej organizacji terrorystycznej.