10. Najlepszy wojownik Ninja. W mieście pojawia się nowy złoczyńca. To wojownik Ninja. Przebył pół galaktyki, by w walce pokonać Shreddera i zdobyć sławę. Kiedy okazuje się, że Leonardo pokonał już Shreddera, intergalaktyczny Wojownik Ninja postanawia walczyć z nim. 11. Powrót Nano. Prawdziwe kłopoty Żółwi zaczynają się, gdy powraca Nano Potwór. Samoreplikująca się techno-machina wydobywa z więzienia swego kryminalnego "ojca", a ten rozpoczyna niszczycielską działalność. Tylko Żółwie mogą go powstrzymać. Ale jak tego dokonać, kiedy zło odradza się szybciej niż się je zniszczy? 12. Ale krokodyl. Żółwie odkrywają, że w kanałach poza nimi żyje ktoś jeszcze. Zielona maź, która dawno temu je zmutowała, zmutowała jeszcze kogoś... Skórzaną Twarz. Czy sfrustrowana, owładnięta strachem ii agresją, ale kontrolowana przez inteligencję, racjonalizm i ciekawość Skórzana Twarz to wróg, czy przyjaciel? I kim jest tajemnicza postać, o której mówił? 13. Powrót do Podziemi. Żółwie powracają do starożytnego podziemnego miasta, które odkryły w "Notatkach z Podziemi" i zauważają, że miasto zostało opuszczone, zniknęła siła kryształowego księżyca, a ludzie pozamieniali się w potwory. Don posiada nietestowaną odtrutkę, aby je wyleczyć i przywrócić im ludzką postać. Ale czy uda im się jej użyć, zanim potwory zniszczą żółwie?