1. Robozbieg. Wojownicze Żółwie Ninja w poszukiwaniu swojego mistrza Splintera przypadkowo zostają przeniesione do innej galaktyki, gdzie poznają Robozbiega - profesora uwięzionego w ciele robota. Wkrótce okazuje się, że jest on jedyną osobą, która mogłaby im pomóc w powrocie na ziemię. 2. Kłopoty z Triceratonami. Generał Blank chce zdobyć teleportal, wysyła swoje wojska, aby złapać Robozbiega i unicestwić Wojownicze Żółwie Ninja. Czy uda im się uciec? Aby tego dokonać, stosują tajną sztukę ninjitsu. Jakby tego było mało, trafiają do wnętrza statku Triceratonów i wraz z nimi odlatują w nieznane. 3. Więzienie. Podążając za Robozbiegiem, Wojownicze Żółwie ninja trafiły na statek Triceratonów, które próbują nakłonić profesora do zbudowania teleportalu. Podczas próby ucieczki bohaterowie zostają pojmani za pomocą broni ogłuszającej i za karę oddelegowani do areny zagłady. 4. Arena. Wojownicze Żółwie Ninja stają przed nie lada zadaniem - muszą stoczyć na arenie pojedynek ze spazmozaurem, który znacznie przewyższa ich swoją siłą. Kiedy okazuje się, że pokonali go z łatwością, mściwy przewodniczący Triceratonów postanawia zafundować im kolejny pojedynek - tym razem z jeszcze bardziej niebezpiecznym przeciwnikiem. 5. Wojny Tryceratonów. Żółwiom udaje się przeżyć więzienie oraz walki na Arenie. Teraz, gdy mają już profesora Honeycutta (Robozbiega), czeka ich o wiele trudniejsze wyzwanie - muszą powrócić do domu. Na dodatek, gdy czekają aż Robozbieg otworzy teleportal, trafiają w sam środek międzygalaktycznej wojny.